Um grande impulso na busca por medicamentos e vacinas pode vir da resposta a algumas perguntas simples sobre as origens do coronavírus que ainda estão em jogo. Em quais espécies animais o Coronavírus se manifestou pela primeira vez Covid-19? Um morcego, um pangolim ou outra espécie selvagem? De onde isso vem? De uma caverna (ou floresta) na província chinesa de Hubei ou em outro lugar?
Em dezembro de 2019, 27 das primeiras 41 pessoas internadas no hospital (66%) passaram por um mercado localizado no centro da cidade de Wuhan, na província de Hubei. Mas, de acordo com um estudo realizado no hospital de Wuhan e publicado no Lancet o primeiro caso humano identificado não compareceu a esse mercado.
Estimativa de datação molecular baseada nas seqüências genômicas SARS-CoV-2 sua origem remonta a novembro. E isso levanta questões sobre as origens do coronavírus, particularmente a ligação entre esta epidemia de COVID-19 e a vida selvagem.
Dados genômicos
Il O genoma de SARS-CoV-2 é foi "rapidamente" sequenciado por pesquisadores chineses. Análise genômica comparativos mostraram que SARS-CoV-2 pertence ao grupo de Betacoronavírus e isso é muito perto de SARS-CoV, responsável por uma epidemia de pneumonia aguda que surgiu em novembro de 2002 na província chinesa de Guangdong e depois se espalhou para 29 países em 2003. A SARS registrou 8.098 casos, incluindo 774 mortes. Sabe-se que esses morcegos são Rhinolophus foram os reservatório deste vírus e que um pequeno carnívoro, a civeta das palmeiras (larva paguma), pode ter sido feito desde convidado intermediário entre os morcegos e os primeiros casos humanos.
Desde então, muitos Betacoronavírus foram descobertos, principalmente em morcegos, mas também em humanos. Por exemplo, RaTG13, isolado de um morcego da espécie rhinolophus affinis coletado na província chinesa de Yunan, foi recentemente descrito como muito semelhante ao SARS-CoV-2, com 96% de sequências genômicas idênticas .
Esses resultados indicam que os morcegos, e principalmente as espécies do gênero Rhinolophus, constituem o reservatório dos vírus SARS-CoV e SARS-CoV-2.
Mas como você define um tanque? Um reservatório é uma ou mais espécies animais que são pouco ou nenhuma suscetível ao vírus, mas o hospedam. A ausência de sintomas da doença é explicada pela eficácia do sistema imunológico desses animais, o que lhes permite combater a proliferação viral.
Mecanismo de recombinação
O 7 de fevereiro 2020 a ciência descobriu mais tarde que um vírus ainda mais próximo do SARS-CoV-2 havia sido descoberto no Pangolin. Com 99% do concordância genômica, o pangolim foi considerado um tanque mais provável que os morcegos.
Todos decidiram sobre as origens do coronavírus, então? Ainda não.
Posteriormente, um estudo mais recente e ainda sob investigação mostra que o genoma do coronavírus isolado do pangolim da Malásia (manis javanica) é menos parecido com SARS-Cov-2, com apenas 90% de concordância genômica. Isso indicaria que o vírus isolado no pangolim não é responsável pelo surto de COVID-19 que está ocorrendo atualmente.
Proteína S
No entanto, o coronavírus isolado do pangolim é 99% semelhante em 74 aminoácidos envolvidos no domínio de ligação do receptor da angiotensina II, o que permite que o vírus entre nas células humanas para infectá-las. Em contraste, o vírus RaTG13 isolado do morcego rhinolophus affinis é altamente divergente nesta parte específica (apenas 77% de semelhança). Na prática, o coronavírus isolado do pangolim é capaz de entrar nas células humanas, enquanto o isolado do bastão rhinolophus affinis não é.
Além disso, essas comparações genômicas sugerem que o vírus SARS-Cov-2 é o resultado de uma recombinação entre dois vírus diferentes, um próximo ao RaTG13 e outro mais próximo ao vírus pangolim. Em outras palavras, seria uma quimera entre dois vírus pré-existentes.
Esse mecanismo de recombinação foi já foi descrito em coronavírus, em particular para explicar a origem do SARS-CoV. É importante saber que a recombinação resulta em um novo vírus potencialmente capaz de infectar uma nova espécie hospedeira.
Para que a recombinação ocorra, os dois vírus divergentes devem ter infectado o mesmo organismo simultaneamente.
Duas questões permanecem sem resposta: em qual organismo essa recombinação ocorreu? (um morcego, um pangolim ou outra espécie?) E sobretudo, em que condições se deu essa recombinação?
